W zorganizowanych wioskach shinobi ninja dostają misje w zależności od ich rangi. Misje dzielą się na pięć kategorii, w oparciu o to jak niebezpieczna i ważna dla wioski jest dana misja.
Misja rangi D
Przypadają one na świeżych Geninów. Nie stanowią zagrożenia życia. Składają się one najczęściej z prac dorywczych.
Przykład: Opieka nad dziećmi.
Nagroda pieniężna: Od 5 do 50 Yie.
Doświadczenie: Od 1 do 10 PD.
Prawdopodobieństwo otrzymania przedmiotu: 1%
Misja rangi C
Przypadają one na doświadczonych Geninów i Chuninów. Niosą ryzyko poniesienia ran przez shinobi które je wykonują.
Przykład: Pokonanie dzikiego zwierzęcia.
Nagroda pieniężna: Od 20 do 100 Yie.
Doświadczenie: Od 7 do 20 PD.
Prawdopodobieństwo otrzymania przedmiotu: 10%
Misja rangi B
Przypadają na doświadczonych Chuninów. Podczas wykonywania tych misji przewidywana jest walka.
Przykład: Ochrona osoby.
Nagroda pieniężna: Od 70 do 200 Yie.
Doświadczenie: Od 15 do 45 PD
Prawdopodobieństwo otrzymania przedmiotu: 15%
Misja rangi A
Przypadają na Joninów. Dotyczą spraw na szczeblu państwowym, lub wioski.
Przykład: Ochrona ważnej osobistości.
Nagroda pieniężna: Od 150 do 500 Yie.
Doświadczenie: Od 40 do 95 PD
Prawdopodobieństwo otrzymania przedmiotu: 30%
Misja rangi S
Przypadają na doświadczonych Joninów i wyższe rangi. Dotyczą poufnych spraw na szczeblu państwowym.
Przykład: Ciche zabójstwo ważnej osobistości.
Nagroda pieniężna: Od 450 do 1500 Yie.
Doświadczenie: Od 90 do 200 PD
Prawdopodobieństwo otrzymania przedmiotu: 50%

WAŻNE: Możliwe jest wykonywanie niższych niż zalecane dla twojej rangi. Wykonywanie misji wyższych niż zalecane tylko za zgodą Kage wioski!